MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium sp. JDM601 chromosome

Total Repeats: 126817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015576	GCG	2	6	215170	215175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988846
6002	NC_015576	CCA	2	6	215186	215191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988846
6003	NC_015576	CCAG	2	8	215198	215205	25 %	0 %	25 %	50 %	333988846
6004	NC_015576	TCG	2	6	215236	215241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988846
6005	NC_015576	CAG	2	6	215244	215249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988846
6006	NC_015576	GGCGG	2	10	215262	215271	0 %	0 %	80 %	20 %	333988846
6007	NC_015576	GAC	2	6	215281	215286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988846
6008	NC_015576	TCG	2	6	215290	215295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988846
6009	NC_015576	GTG	2	6	215305	215310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988846
6010	NC_015576	GCA	2	6	215354	215359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988846
6011	NC_015576	CGG	2	6	215371	215376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988846
6012	NC_015576	CTG	2	6	215437	215442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_015576	CCG	2	6	215493	215498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6014	NC_015576	CTC	2	6	215519	215524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6015	NC_015576	CGC	2	6	215537	215542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6016	NC_015576	GCA	2	6	215543	215548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_015576	GC	3	6	215693	215698	0 %	0 %	50 %	50 %	333988847
6018	NC_015576	CCA	2	6	215734	215739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988847
6019	NC_015576	AAG	2	6	215740	215745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333988847
6020	NC_015576	CGG	2	6	215811	215816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988847
6021	NC_015576	GCC	2	6	215823	215828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988847
6022	NC_015576	TCG	2	6	215836	215841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988847
6023	NC_015576	GAGC	2	8	215903	215910	25 %	0 %	50 %	25 %	333988847
6024	NC_015576	CGA	2	6	216014	216019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988847
6025	NC_015576	CGGG	2	8	216078	216085	0 %	0 %	75 %	25 %	333988847
6026	NC_015576	GCC	2	6	216178	216183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6027	NC_015576	CAT	2	6	216200	216205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988848
6028	NC_015576	CG	4	8	216234	216241	0 %	0 %	50 %	50 %	333988848
6029	NC_015576	ACG	2	6	216296	216301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988848
6030	NC_015576	ATC	2	6	216304	216309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988848
6031	NC_015576	GC	3	6	216341	216346	0 %	0 %	50 %	50 %	333988848
6032	NC_015576	CAG	2	6	216355	216360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988848
6033	NC_015576	CGGC	2	8	216405	216412	0 %	0 %	50 %	50 %	333988848
6034	NC_015576	CCGA	2	8	216413	216420	25 %	0 %	25 %	50 %	333988848
6035	NC_015576	GGC	2	6	216547	216552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988848
6036	NC_015576	CGT	2	6	216585	216590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988848
6037	NC_015576	AGC	2	6	216605	216610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988848
6038	NC_015576	GGTG	2	8	216643	216650	0 %	25 %	75 %	0 %	333988848
6039	NC_015576	GCA	2	6	216657	216662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988848
6040	NC_015576	CGA	2	6	216708	216713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988848
6041	NC_015576	CGCT	2	8	216719	216726	0 %	25 %	25 %	50 %	333988848
6042	NC_015576	CGG	2	6	216752	216757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988848
6043	NC_015576	CAG	2	6	216769	216774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988848
6044	NC_015576	ATC	2	6	216785	216790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988848
6045	NC_015576	CCGG	2	8	216791	216798	0 %	0 %	50 %	50 %	333988848
6046	NC_015576	GGGATC	2	12	216815	216826	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	333988848
6047	NC_015576	GTG	2	6	216953	216958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988848
6048	NC_015576	GAA	2	6	216964	216969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333988848
6049	NC_015576	GTC	2	6	216974	216979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988848
6050	NC_015576	GCG	2	6	216995	217000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988848
6051	NC_015576	CCA	2	6	217095	217100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988848
6052	NC_015576	GCC	2	6	217103	217108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988848
6053	NC_015576	CGG	2	6	217159	217164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988848
6054	NC_015576	CGGG	2	8	217200	217207	0 %	0 %	75 %	25 %	333988848
6055	NC_015576	TCA	2	6	217284	217289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988848
6056	NC_015576	CCA	2	6	217308	217313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988848
6057	NC_015576	GCGGT	2	10	217403	217412	0 %	20 %	60 %	20 %	333988848
6058	NC_015576	CCG	2	6	217413	217418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988848
6059	NC_015576	GTG	2	6	217427	217432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988848
6060	NC_015576	TAAC	2	8	217548	217555	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6061	NC_015576	GTT	2	6	217580	217585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_015576	CGC	2	6	217700	217705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988849
6063	NC_015576	TCG	2	6	217786	217791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988849
6064	NC_015576	GATC	2	8	217796	217803	25 %	25 %	25 %	25 %	333988849
6065	NC_015576	GCGG	2	8	217814	217821	0 %	0 %	75 %	25 %	333988849
6066	NC_015576	ACG	2	6	217851	217856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988849
6067	NC_015576	GCG	2	6	217870	217875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988849
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6070	NC_015576	C	6	6	217949	217954	0 %	0 %	0 %	100 %	333988849
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6101	NC_015576	CGG	2	6	219218	219223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_015576	GGT	2	6	219229	219234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_015576	GCC	2	6	219369	219374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988851
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6110	NC_015576	TCGA	2	8	219726	219733	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6111	NC_015576	CTC	2	6	219753	219758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6112	NC_015576	ATAG	2	8	219792	219799	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_015576	CAA	2	6	219829	219834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_015576	GAGG	2	8	219836	219843	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_015576	G	6	6	219842	219847	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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6118	NC_015576	CCGA	2	8	219922	219929	25 %	0 %	25 %	50 %	333988852
6119	NC_015576	AAG	2	6	219964	219969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333988852
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6122	NC_015576	CGT	2	6	220031	220036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988852
6123	NC_015576	CGA	2	6	220040	220045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988852
6124	NC_015576	CTG	2	6	220048	220053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988852
6125	NC_015576	ACC	2	6	220090	220095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988852
6126	NC_015576	ACC	2	6	220099	220104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988852
6127	NC_015576	CAC	2	6	220110	220115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333988852
6128	NC_015576	GCA	2	6	220155	220160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988852
6129	NC_015576	GCC	2	6	220243	220248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988852
6130	NC_015576	GCT	2	6	220275	220280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988852
6131	NC_015576	GTC	2	6	220303	220308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988852
6132	NC_015576	TTC	2	6	220450	220455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333988852
6133	NC_015576	TCT	2	6	220466	220471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333988852
6134	NC_015576	GCC	2	6	220473	220478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988852
6135	NC_015576	TCG	2	6	220556	220561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988852
6136	NC_015576	GGC	2	6	220567	220572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988852
6137	NC_015576	GAG	2	6	220609	220614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333988852
6138	NC_015576	ACGGCC	2	12	220646	220657	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	333988852
6139	NC_015576	GGA	2	6	220665	220670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333988852
6140	NC_015576	TGC	2	6	220808	220813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988852
6141	NC_015576	AGC	2	6	220814	220819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988852
6142	NC_015576	TGC	2	6	220850	220855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988852
6143	NC_015576	CGGC	2	8	220872	220879	0 %	0 %	50 %	50 %	333988852
6144	NC_015576	GGCCGC	2	12	220923	220934	0 %	0 %	50 %	50 %	333988852
6145	NC_015576	GC	4	8	220985	220992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6146	NC_015576	CGT	2	6	220993	220998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6147	NC_015576	GC	3	6	221036	221041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6148	NC_015576	GGC	2	6	221065	221070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6149	NC_015576	GCT	2	6	221086	221091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6150	NC_015576	GC	3	6	221098	221103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6151	NC_015576	GATGA	2	10	221132	221141	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6152	NC_015576	GCTT	2	8	221145	221152	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6153	NC_015576	GA	3	6	221172	221177	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6154	NC_015576	CTA	2	6	221204	221209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333988853
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6156	NC_015576	TGCGGC	2	12	221281	221292	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	333988853
6157	NC_015576	GAG	2	6	221298	221303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333988853
6158	NC_015576	GCCG	2	8	221372	221379	0 %	0 %	50 %	50 %	333988853
6159	NC_015576	CGA	2	6	221387	221392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988853
6160	NC_015576	GGGC	2	8	221480	221487	0 %	0 %	75 %	25 %	333988853
6161	NC_015576	CACG	2	8	221546	221553	25 %	0 %	25 %	50 %	333988853
6162	NC_015576	CTG	2	6	221571	221576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988853
6163	NC_015576	CGG	2	6	221603	221608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988853
6164	NC_015576	GCC	2	6	221618	221623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988853
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6167	NC_015576	GGT	2	6	221868	221873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6168	NC_015576	GC	3	6	221910	221915	0 %	0 %	50 %	50 %	333988854
6169	NC_015576	GCC	2	6	221919	221924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988854
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6171	NC_015576	GC	3	6	221996	222001	0 %	0 %	50 %	50 %	333988854
6172	NC_015576	TCG	2	6	222061	222066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988854
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6182	NC_015576	GCCGAC	2	12	222339	222350	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	333988854
6183	NC_015576	GCT	2	6	222359	222364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988854
6184	NC_015576	GCT	4	12	222368	222379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988854
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6190	NC_015576	TCGCCA	2	12	222524	222535	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	333988854
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6195	NC_015576	GAC	2	6	222686	222691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988855
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6197	NC_015576	TG	3	6	222735	222740	0 %	50 %	50 %	0 %	333988855
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6200	NC_015576	GC	3	6	222802	222807	0 %	0 %	50 %	50 %	333988855
6201	NC_015576	CGA	2	6	222823	222828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988855
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6203	NC_015576	CGA	2	6	222910	222915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988855
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6207	NC_015576	GTCG	2	8	222994	223001	0 %	25 %	50 %	25 %	333988855
6208	NC_015576	GCG	2	6	223028	223033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988855
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6212	NC_015576	CGA	3	9	223153	223161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988855
6213	NC_015576	GCG	2	6	223162	223167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988855
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6216	NC_015576	GAAC	2	8	223249	223256	50 %	0 %	25 %	25 %	333988855
6217	NC_015576	TCC	2	6	223328	223333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333988855
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6222	NC_015576	CGA	2	6	223462	223467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333988855
6223	NC_015576	CCAC	2	8	223516	223523	25 %	0 %	0 %	75 %	333988856
6224	NC_015576	GCC	2	6	223595	223600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988856
6225	NC_015576	TGA	2	6	223636	223641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333988856
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6227	NC_015576	TCG	2	6	223662	223667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988856
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6233	NC_015576	GCCG	2	8	223904	223911	0 %	0 %	50 %	50 %	333988856
6234	NC_015576	CCG	3	9	223909	223917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988856
6235	NC_015576	CTG	2	6	223928	223933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988856
6236	NC_015576	TCG	2	6	223941	223946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988856
6237	NC_015576	GTCG	2	8	223988	223995	0 %	25 %	50 %	25 %	333988856
6238	NC_015576	GTC	2	6	224045	224050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988856
6239	NC_015576	GTT	2	6	224102	224107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333988856
6240	NC_015576	GTC	2	6	224130	224135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988856
6241	NC_015576	GCC	2	6	224183	224188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988856
6242	NC_015576	GT	3	6	224202	224207	0 %	50 %	50 %	0 %	333988856
6243	NC_015576	TCG	2	6	224214	224219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988856
6244	NC_015576	ACCG	2	8	224235	224242	25 %	0 %	25 %	50 %	333988856
6245	NC_015576	CCGG	2	8	224244	224251	0 %	0 %	50 %	50 %	333988856
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6361	NC_015576	CG	3	6	228310	228315	0 %	0 %	50 %	50 %	333988858
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6483	NC_015576	TGA	2	6	232512	232517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333988861
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6487	NC_015576	GCCCG	2	10	232591	232600	0 %	0 %	40 %	60 %	333988861
6488	NC_015576	CGG	2	6	232627	232632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6489	NC_015576	TGC	2	6	232684	232689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988862
6490	NC_015576	GGC	2	6	232768	232773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333988862
6491	NC_015576	GTG	2	6	232787	232792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988862
6492	NC_015576	GTCG	2	8	232842	232849	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6493	NC_015576	CAG	2	6	232860	232865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6494	NC_015576	TGG	2	6	232888	232893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988863
6495	NC_015576	CCG	2	6	232928	232933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988863
6496	NC_015576	TGG	3	9	232991	232999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333988863
6497	NC_015576	CTG	2	6	233077	233082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333988863
6498	NC_015576	CGGC	2	8	233087	233094	0 %	0 %	50 %	50 %	333988863
6499	NC_015576	GCC	2	6	233201	233206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333988864
6500	NC_015576	GCCG	2	8	233234	233241	0 %	0 %	50 %	50 %	333988864

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